简短回答
两篇祷文都是先赞美神，然后才向他祈求，但它们对他的称呼不同。《古兰经》的首章开端章赞美安拉(﷾)为众世界的主。它从不称他为父。在主祷文中，门徒直接求神赦免他们。紧接着，耶稣说神饶恕那些饶恕别人的人。他没有提出别的条件，也没有提到十字架或血。《古兰经》教导同样的联系，而伊斯兰教说安拉(﷾)饶恕那些归向他的人。在许多《圣经》中，主祷文还以“因为国度、权柄、荣耀，全是你的”结尾。这几个字不见于马太福音最古老的希腊文抄本，路加福音中的这篇祷文也没有它们。穆斯林按照先知(ﷺ)的教导，在每一次礼拜中诵读开端章。
完整解释
耶稣所教导的祷文
马太和路加都记载了耶稣教导门徒的祷文。基督徒每天和在教会中念诵它。在马太福音中，它以称呼神为“我们在天上的父”开始。在英王钦定本（1611年的古英语《圣经》）中，它以赞美神的国度、权柄和荣耀结束。路加福音较短的版本没有这样的结尾。
“所以，你们祷告要这样说：我们在天上的父，愿人都尊你的名为圣。愿你的国降临；愿你的旨意行在地上，如同行在天上。我们日用的饮食，今日赐给我们。免我们的债，如同我们免了人的债。不叫我们遇见试探；救我们脱离凶恶。因为国度、权柄、荣耀，全是你的，直到永远。阿们！”
“耶稣说：你们祷告的时候，要说：我们在天上的父，愿人都尊你的名为圣。愿你的国降临。愿你的旨意行在地上，如同行在天上。我们日用的饮食，天天赐给我们。赦免我们的罪，因为我们也赦免凡亏欠我们的人。不叫我们遇见试探，救我们脱离凶恶。”
《古兰经》的开篇一章
开端章（法蒂哈）共七节。它赞美安拉(﷾)为众世界的主和养育者。它宣告惟有他受崇拜，惟有向他求助。它求他引领人上正路。先知(ﷺ)教导说，没有它，礼拜就无效，所以穆斯林每天诵读它许多次。
“奉至仁至慈的安拉之名一切赞颂，全归安拉，养育众世界的主，至仁至慈的主，报应日的主。我们只崇拜你，我们只求你祐助。求你引领我们上正路，你所祐助者的路，不是受谴怒者的路，也不是迷误者的路。”
欧巴代·本·萨米特传述，先知(ﷺ)说，不诵读开端章（法蒂哈）的礼拜是无效的。
两篇祷文怎样称呼神
两篇祷文都是先赞美神，然后才向他祈求。主祷文说：“愿人都尊你的名为圣”。开端章说：‘一切赞颂，全归安拉’。两者也都表示顺服：“愿你的旨意行在地上，如同行在天上”，以及“我们只崇拜你”。不同之处在于怎样称呼神。主祷文说‘父’。开端章说众世界的主、至仁至慈的主、报应日的主。它从不说父。穆斯林认为，独一的神所派遣的先知们，会以同样的精神教导祷告。
“所以，你们祷告要这样说：我们在天上的父，愿人都尊你的名为圣。愿你的国降临；愿你的旨意行在地上，如同行在天上。我们日用的饮食，今日赐给我们。免我们的债，如同我们免了人的债。不叫我们遇见试探；救我们脱离凶恶。因为国度、权柄、荣耀，全是你的，直到永远。阿们！”
“奉至仁至慈的安拉之名一切赞颂，全归安拉，养育众世界的主，至仁至慈的主，报应日的主。我们只崇拜你，我们只求你祐助。求你引领我们上正路，你所祐助者的路，不是受谴怒者的路，也不是迷误者的路。”
不需要献祭的赦免
门徒求神自己赦免他们。耶稣随即解释了这种赦免取决于什么：饶恕别人。这里没有一句话提到必须先付出的血、十字架或祭物。《古兰经》也教导饶恕别人与蒙安拉(﷾)饶恕之间的同样联系。
“你们饶恕人的过犯，你们的天父也必饶恕你们；你们不饶恕人的过犯，你们的父也必不饶恕你们的过犯。”
“你们中有恩惠和财富者不可发誓（说）：永不周济亲戚、贫民及为主道而迁居者。他们应当恕饶，应当原谅。难道你们不愿安拉赦宥你们吗？安拉是至赦的，是至慈的。”
主祷文与开端章：比较说明了什么
- 两篇祈祷词都是先赞美真主(﷾)，再向他祈求，但对他的称呼不同。
- 开端章称真主(﷾)为众世界的主、至仁的、至慈的。它从不称他为父。
- 耶稣说，真主(﷾)饶恕那些饶恕别人的人，他没有提到十字架或血。《古兰经》教导的是同样的联系。
最古老的抄本所没有的结尾
“因为国度、权柄、荣耀，全是你的，直到永远。阿们！”这几个字出现在英王钦定本的马太福音 6:13 中。它们不在最古老的希腊文抄本里。NIV（新国际版）等现代译本把它们从正文中删去。路加福音的版本也没有这样的结尾。所以，最古老的抄本所显示的祷文，比英王钦定本所印的要短。
“不叫我们遇见试探，救我们脱离凶恶。因为国度、权柄、荣耀，全是你的，直到永远。阿们！”
关于马太福音 6:13，书中指出，结尾的“因为国度、权柄、荣耀，全是你的”这几个字，不见于早期的重要抄本（其中包括西奈抄本和梵蒂冈抄本），也不见于早期注释这篇祷文的人，而且流传的形式有好几种。结论是，这几个字是后来加上的，很可能是为了教会崇拜之用，取材于历代志上 29:11-13。
新国际版（NIV）把英王钦定本（KJV）中的十六节经文从正文中删去，只在脚注中给出：马太福音 17:21、18:11和23:14；马可福音 7:16、9:44、9:46、11:26和15:28；路加福音 17:36和23:17；约翰福音 5:4；使徒行传 8:37、15:34、24:7和28:29；以及罗马书 16:24。它印出马可福音 16:9-20和约翰福音 7:53-8:11，并注明最早的抄本没有这些经文。它的主祷文在马太福音 6:13结束，没有“因为国度、权柄、荣耀全是你的，直到永远。阿们”，并注明只有一些晚期抄本加上了这句。在歌罗西书 1:14，它作“救赎，就是罪得赦免”，没有“借着他的血”。在启示录中，它缺少英王钦定本中的十三处字词或短语，分别在1:8、1:11（两处）、5:14、11:1、11:17、14:12、15:2、16:5、16:7、16:14、19:1和21:24。
这篇祷文需要十字架吗？
马太福音 26:28 — 第26章，第28节
“因为这是我立新约的血，为多人流出来，使罪得赦。”
引用目的
在最后的晚餐上，耶稣说他的血是为使罪得赦而流的。基督徒透过这节经文来理解主祷文中所求的赦免。
回应
耶稣教导这篇祷文远在最后的晚餐之前。紧接着他就解释了祷文中求赦免的意思：神饶恕那些饶恕别人的人。他在别处说：“你们且去揣摩：‘我喜爱怜恤，不喜爱祭祀’这句话是什么意思。”在路加福音中，他讲到一个税吏只是求神怜悯，就回家去算为义了。在这些经文中，赦免是从神那里临到祈求的人，不需要祭物。
结论 — 耶稣自己对这篇祷文的解释，以及他在路加福音中的比喻，把赦免与求告神和饶恕别人联系在一起，而不是与祭物联系在一起。
不同观点
主流基督教
基督徒认为，主祷文是耶稣赐给他的追随者的模范祷文。他们说，称神为‘父’表达了耶稣为他们开启的亲密关系。他们还说，他们所求的赦免建立在他的死上。
耶稣教导门徒称呼神为“我们在天上的父”。
反驳
姑且承认马太和路加记载了这篇祷文。在马太福音中，耶稣告诉他所有的门徒都说“我们在天上的父”，而神称以色列全民为“以色列是我的儿子，我的长子”。所以这个称呼是所有祷告的人共有的，而《圣经》称一整个民族为神的儿子，却并不因此使它成为神。《古兰经》不用这个称呼也表明了真主(﷾)的亲近：“我确是临近的”。
基督徒认为，祷文中所求的赦免是借着耶稣的血得到保证的。他们说，那血是为“使罪得赦”而流的。
反驳
姑且承认马太记载了耶稣在最后的晚餐上说的这些话。耶稣教导这篇祷文远在那之前，而且紧接着就解释了祷文中求赦免的意思：神饶恕那些饶恕别人的人。他在别处说：“你们且去揣摩：‘我喜爱怜恤，不喜爱祭祀’这句话是什么意思。”在路加福音中，一个税吏求神怜悯，就回家去算为义了。
伊斯兰的观点
开端章是先知(ﷺ)使之成为每一次穆斯林礼拜之一部分的祷文。它先赞美真主(﷾)，然后求他引导。它称真主(﷾)为众世界的主，从不称他为父。自从先知(ﷺ)教导它以来，穆斯林在每一次礼拜中都诵读它。
开端章赞美安拉(﷾)，宣告惟有他受崇拜，并求他引导。
先知(ﷺ)教导说，没有开端章，礼拜就无效。
英王钦定本以一段结束语结束主祷文。这段话不见于马太福音最古老的希腊文抄本，也不见于路加福音的版本。
耶稣把神的饶恕与饶恕别人联系在一起，没有提到任何祭物。
《古兰经》把蒙安拉(﷾)饶恕与饶恕别人联系在一起。
伊斯兰教教导说，安拉(﷾)饶恕那些归向他的人，不需要任何血。即使说到献牲，《古兰经》也说，能达到安拉(﷾)的是虔诚，而不是它们的血。