简短回答
鼓励。降示给先知穆罕默德(ﷺ)的第一个词是‘宣读！’，同一段经文还讲到真主(﷾)用笔教人。《古兰经》教信士祈祷：“我的主啊！求你增加我的知识。”它问道，有知识的与无知识的能相等吗？它一再把天空、雨水、昼夜称为迹象。先知(ﷺ)说，谁走上一条寻求知识的道路，真主(﷾)就为他铺平一条通往乐园的道路。他告诉农夫们，他们比他更清楚他们今世的事务。所以穆斯林毫无畏惧地研究自然界。11世纪，伊本·海赛木通过实验检验了关于光和视觉的古老观念。科学告诉我们世界怎样运作，启示告诉我们世界为什么存在。二者不是对手。伊斯兰教作为一种完整的生活方式，二者都欢迎。
完整解释
第一道命令是宣读
降示给先知(ﷺ)的最初几节经文，以iqra一词开头，意思是读或诵读。它们讲到笔，讲到真主(﷾)教人知道自己所不知道的东西。后来，《古兰经》教给信士一句求增加知识的简短祈祷。它还问道，有知识的与无知识的相等吗？先知(ﷺ)应许，谁走上一条寻求知识的道路，就会发现通往乐园的道路已为他铺平。在同一段话中，他称赞了那些聚集在一起研习《古兰经》的人。
“你应当奉你的创造主的名义而宣读，他曾用血块创造人。你应当宣读，你的主是最尊严的，他曾教人用笔写字，他曾教人知道自己所不知道的东西。”
阿伊莎讲述最初的启示。在希拉山洞里，天使让先知(ﷺ)诵读，他三次回答说自己不会读，随后《血块章》的最初几节降示给他。赫蒂彻带他去见她的堂兄沃拉格·本·瑙法勒，那是一位双目失明的老人，已成为基督徒，曾用希伯来文字抄写部分福音书。沃拉格说，这就是真主曾派给摩西的那位天使。几天后他便去世了。
“安拉是超绝万物，宰制众生，体用真实的。对你启示《古兰经》还没有完全的时候，你不要急忙诵读。你说：“我的主啊！求你增加我的知识。””
“（景况更好的，是你呢？）还是在夜间专心事主，叩头立正，谨防后世，希望主恩的人呢？你说：“有知识的与无知识的相等吗？惟有理智的人能觉悟。””
艾布·胡莱勒传述了先知(ﷺ)一段较长的话，讲到善行及其报酬。其中说：谁走上一条寻求知识的道路，安拉就为他铺平一条通往乐园的道路；人们聚集在清真寺里诵读《古兰经》并一起研习它时，安宁就降临他们，慈悯就笼罩他们，天使就环绕他们。这段话的结尾说：谁因自己的行为而落后，他的家世也不会使他前进。
被造之物是一本迹象之书
《古兰经》用同一个词ayat（迹象）来称呼它自己的经文和被造之物。诸天、雨水、风、动物以及昼夜的轮流，都被称为给运用理智之人的迹象。它称赞那些深思天地是怎样被创造的人。它还指引人们去看大地上和他们自身中的迹象。它并不要求人先信、后明白。它要求读者去看这个世界，并思考它。
“天地的创造，昼夜的轮流，利人航海的船舶，安拉从天上降下雨水，借它而使已死的大地复生，并在大地上散布各种动物，与风向的改变，天地间受制的云，对于能了解的人看来，此中确有许多迹象。”
“天地的创造，昼夜的轮流，在有理智的人看来，此中确有许多迹象。他们站着、坐着，躺着记念安拉，并思维天地的创造，（他们说）：我们的主啊！你没有徒然地创造这个世界。我们赞颂你超绝万物，求你保护我们，免受火狱的刑罚。”
“对于笃信的人们，大地上有许多迹象；在你们自身中也有许多迹象，难道你们看不见吗？”
“我将在四方和在他们自身中，把我的许多迹象昭示他们，直到他们明白《古兰经》确是真理。难道你的主能见证万物还不够吗？”
使人敬畏真主(﷾)的知识
《古兰经》描述了果实、山岳、人和动物的各种颜色。然后它说，只有有知识的人才真正敬畏真主(﷾)，也就是对他怀着敬畏之心。研究被造的世界，是为了加深信仰，而不是威胁信仰。
“人类，野兽和牲畜中，也同样地有不同的种类。安拉的仆人中，只有学者敬畏他。安拉确是万能的，确是至赦的。”
世俗的技能和启示是两回事
在他定居的城市麦地那，先知(ﷺ)经过一些正在用手给椰枣树授粉的农夫。他随口说了一个看法：认为没有必要这样做。他们就停止了，结果收成减少。他告诉他们，那只是他自己的看法。他说，他们更清楚自己今世的事务，只有他从真主(﷾)那里传达的才必须遵从。种植椰枣树是靠反复试验学来的；来自真主(﷾)的则不是。正因为如此，穆斯林可以研究星辰和人体，而不觉得他们的信仰因此受到威胁。
泰勒哈传述，先知(ﷺ)经过一些正在用手给椰枣树授粉的人，说他认为这样做没有用处。他们就停止了，结果收成减少。先知于是说，如果这样做有益，他们就应当去做，因为那只是他自己的看法；但当他把来自安拉的事告诉他们时，他们必须遵从，因为他绝不会假借安拉说任何虚假的话。
艾奈斯和阿伊莎传述了同一件事：椰枣收成减少之后，先知(ﷺ)对农夫们说，他们更清楚自己今世的事务。
检验古人的穆斯林
穆斯林学者运用了这种自由。伊本·海赛木是11世纪的穆斯林学者。他在《光学之书》中，通过仔细的观察和实验检验了关于光和视觉的观念。在《对托勒密的质疑》中，他列出了托勒密著作中的矛盾；托勒密生活在2世纪，是古代世界最受尊崇的天文学家。伊本·海赛木认为，即使是最伟大的权威也必须受到检验。
伊本·海赛木《光学之书》（《视学书》，11世纪初）第一至第三卷的英译与研究。书中表明，他通过有控制的观察和实验来检验关于光和视觉的理论。
伊本·海赛木对托勒密这位古代世界最受尊崇的天文学家的批评。他列出托勒密著作中的矛盾和薄弱之处，并主张即使是最伟大的权威也必须受到检验。
波斯人、阿拉伯人和安达卢斯人
穆斯林学者来自许多民族。有人说他们其实是波斯人，伊斯兰教把他们的成果据为己有。他们当中许多人是波斯人，而他们是穆斯林。伊本·西那生于布哈拉附近，主要用阿拉伯文写作。另一些人根本不是波斯人。铿迪是金代部落的阿拉伯人，生于库法。在西班牙，穆斯林从711年到1492年统治安达卢斯。伊本·鲁世德（阿威罗伊）生于穆斯林世界最西端的科尔多瓦。在拉丁欧洲，人们径直称他为“注释家”，诗人但丁把他列在过去的伟大心灵之中。这些学者在巴格达、开罗和科尔多瓦等穆斯林城市工作，那是在伊斯兰教兴起几个世纪之后。他们也说明了自己从别人那里学到了什么。花拉子米写了关于印度计算方法的书，伊本·海赛木写了《对托勒密的质疑》。伊斯兰教从未说过一个民族比另一个民族优越（49:13）。
伊本·西那（阿维森纳，约970-1037年）生于布哈拉附近的一个村庄阿夫沙纳；他的父亲来自巴尔赫。他用流畅的阿拉伯文散文写作，并用波斯文写了一部著作，即《献给阿拉·道莱的哲学》。
铿迪约801年生于伊拉克的库法，873年卒于巴格达。他是来自阿拉伯南部的王族金代部落的后裔。哈里发麦蒙任命他到巴格达的智慧宫，他在那里从事希腊科学手稿的翻译工作。
一部安达卢斯的政治史，从公元711年穆斯林征服到1492年格拉纳达陷落。
伊本·鲁世德（阿威罗伊）1126年生于科尔多瓦，1198年去世，据一种说法卒于马拉喀什。从13世纪初到文艺复兴，他在拉丁欧洲的影响巨大；到1230年代，他在那里被称为“注释家”。
“盖伦、希波克拉底和阿维森纳，还有作了那部伟大注疏的阿威罗伊。”
花拉子米约生于780年，约卒于850年，是哈里发麦蒙治下巴格达智慧宫的学者。他关于算术的书只有一个拉丁文版本留存，名为《花拉子米论印度计算术》，其中阐述了印度的位值记数法。他的《代数学》中虔诚的序言表明他是一位正统的穆斯林。
伊本·海赛木对托勒密这位古代世界最受尊崇的天文学家的批评。他列出托勒密著作中的矛盾和薄弱之处，并主张即使是最伟大的权威也必须受到检验。
“众人啊！我确已从一男一女创造你们，我使你们成为许多民族和部落，以便你们互相认识。在安拉看来，你们中最尊贵者，是你们中最敬畏者。安拉确是全知的，确是彻知的。”
科学和启示回答不同的问题
科学描述事物怎样运作，而且做得极好。它不能说明为什么会有任何东西存在，也不能说明人应当做什么。20世纪获得诺贝尔奖的生物学家彼得·梅达沃写道，科学不能回答关于最初和最终之事的问题。这些问题是：万物怎样开始，我们为何在此，活着的意义是什么。‘只有科学能证明的才是真的’这一主张，本身就不能被科学证明。科学坦承，它的发现只是暂时成立的。托勒密以地球为中心的天体体系，曾是当时最好的科学，以太（一种曾被认为充满空间的看不见的物质）也是如此。二者都被放弃了。连牛顿定律也被爱因斯坦证明只是非常接近真实。一个只接受科学所证明之事的人，仍然是凭信任接受这条规则，并持守着可能改变的答案。《古兰经》在同一点上使信士保持谦卑，提醒他：人们所获得的知识只是很少的。所以，穆斯林可以既热爱科学，也热爱启示，并向二者各自提出它所能回答的问题。
一位诺贝尔奖得主生物学家论证说，科学是理解自然界最成功的方法，但它有其局限：它不能回答关于最初和最终之事的问题，例如万物如何开始、我们为何在此、活着的意义是什么。
“他们问你精神是什么？你说：“精神是我的主的机密。”你们只获得很少的知识。”
不同观点
宗教终结了穆斯林的科学时代
一种流行的现代说法归咎于安萨里。它说，他对哲学家的攻击，以及他关于真主是一切所发生之事的真正原因的教导，使穆斯林背离了科学。它说，在他之后，穆斯林的科学衰落了。
安萨里教导说，火烧棉花不是凭火本身，而是因为真主的定然。这破坏了科学所需要的自然原因的观念。
反驳
安萨里并不否认原因和结果是相联系的。他只是否认这种联系不靠真主(﷾)就能自行成立。他接受天文学家关于日月食的证明。而且在他之后几个世纪，穆斯林地区的天文学仍不断产生新的成果。
穆斯林的黄金时代是波斯人的成果
有人说，穆斯林黄金时代的学者其实是波斯人，波斯被征服后，伊斯兰教把他们的成果据为己有。
穆斯林的黄金时代其实是波斯人的成果，是在波斯被征服后被据为己有的。
反驳
那些学者中许多人是波斯人，而他们是穆斯林，主要用阿拉伯文写作。另一些人是阿拉伯人，如铿迪；或来自西班牙，如科尔多瓦的伊本·鲁世德。他们在伊斯兰教兴起几个世纪之后工作，并公开说明自己从希腊人和印度人那里学到了什么。
历史学家的记载
中世纪的穆斯林学者通过实验和批评，检验了他们所继承的科学。
11世纪初，伊本·海赛木写了《光学之书》。他在其中通过仔细的实验检验了关于光和视觉的观念。
在《对托勒密的质疑》中，伊本·海赛木列出了古代世界首屈一指的天文学家著作中的矛盾。
穆斯林学者来自许多民族。伊本·西那是波斯人，铿迪是阿拉伯人，伊本·鲁世德是来自科尔多瓦的安达卢斯人。
伊斯兰的观点
寻求知识是信仰的一部分。《古兰经》命令宣读，称赞有知识的人，并把读者引向作为迹象之书的被造之物。先知(ﷺ)在世俗技能和启示之间划了一条清楚的界线，使自然界向研究敞开。
最初的启示命令宣读，并讲到真主(﷾)用笔教人。《古兰经》还教信士求真主(﷾)增加他的知识。
《古兰经》问道，有知识的与无知识的相等吗？它说，只有有知识的人才真正敬畏真主(﷾)。
《古兰经》称被造之物为迹象，并一再叫人们思考它们。
先知(ﷺ)教导说，走上一条寻求知识的道路，通往乐园的道路就会变得容易。
在关于椰枣树的记述中，先知(ﷺ)称他关于耕种的建议是他个人的看法。他告诉农夫们，他们更清楚自己今世的事务。
真主(﷾)使研究他的创造成为认识他的道路，所以科学和信仰不是对手。
彼得·梅达沃是20世纪获得诺贝尔奖的生物学家。他写道，科学不能回答万物怎样开始、生命为了什么。